Glosario de términos genéticos

AAXO

Tipo de aberración cromosómica que conlleva la pérdida de un heterocromosoma X.

Aberración cromosómica

Tipo de mutación relacionada con grandes cambios cromosomales.

Acetilación de histonas

Adición de un grupo acetilo (molécula de tres carbonos) a un "residuo" de lisina en un extremo de una molécula de histona.

ADN

Ácido desoxirribonucleico. Molécula que contiene instrucciones genéticas utilizadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos vivos conocidos y algunos virus. Se presenta como una hélice de doble cadena donde la información genética se codifica gracias a una secuencia de nucleótidos ( guanina, adenina, timina y citosina), que se representan con las letras G, A, T y C, respectivamente.

Adenina

Base púrica del ADN y ARN. Se aparea con timina en secuencias duplex de ADN, con adenina (en ADN) y con uracilo (en RNA) en secuencias duplex ADN-ARN.

Alelo

Una de las varias formas alternativas de un gen o una secuencia de ADN que puede existir en un lugar cromosómico determinado (locus ). En cada locus autosómico un individuo posee dos alelos, uno en el cromosoma de origen materno y uno en el paterno.

Alteración cromosómica

Tipo de alteración genética que afecta a una parte o totalidad de un cromosoma, pudiendo alterar la expresión de cientos o miles de genes simultáneamente. El síndrome de Down es un ejemplo.

Amniocentesis

Procedimiento que se utiliza para el diagnóstico de alteraciones cromosómicas fetales. Requiere la obtención de líquido amniótico y recuperación de células fetales.

Anafase

Etapa de la división celular en la cual los cromosomas previamente duplicados migran a diferentes polos de la célula.

Aneuploidía

Alteración en el número de uno o varios cromosomas. Las trisomías son un ejemplo.

ARN

Ácido ribonucleico; macromoléculas que desempeñan diversas funciones vitales en la codificación, descodificación, regulación y expresión de los genes. Al igual que el ADN, es un ácido nucleico y, junto con las proteínas, constituyen los tres grandes tipos de macromoléculas esenciales para todas las formas de vida.

Array CGH

Hibridación genómica comparada. Técnica de diagnóstico genético de última generación que permite diagnosticar anomalías cromosómicas con una resolución superior a las técnicas convencionales (análisis citogenético convencional que estudia la estructura, función y comportamiento de los cromosomas). Este test es una herramienta de estudio del genoma humano precisa y rápida, mediante la que se pueden detectar alteraciones en el ADN, incluidas mcrodelecciones y duplicaciones.

Autosómico dominante

Patrón de herencia clásico o mendeliano que se caracteriza por la presencia del fenómeno de dominancia genética en un alelo de un gen cuyo locus se encuentra ubicado en alguno de los autosomas. Por este mecanismo una determinada característica heredable se transmite de una forma que se puede predecir al margen del sexo del descendiente. Además, para que esta característica heredable se exprese basta con que el descendiente reciba el gen de uno solo de sus progenitores. En una enfermedad autosómica dominante, basta con que el individuo reciba el alelo anormal de uno de sus progenitores para heredar la enfermedad.

Autosómico recesivo

Patrón de herencia clásico o mendeliano que se caracteriza por no presentar el fenómeno de dominancia genética, el fenotipo que caracteriza al alelo recesivo se encuentra codificado un gen cuyo locus se encuentra ubicado en alguno de los autosomas.Por este mecanismo, una determinada característica heredable se transmite en una forma que puede ser predicha sin tener en consideración el sexo del descendiente.Y para que esta característica heredable se exprese es necesario que el descendiente reciba el gen o el alelo mutado de ambos progenitores.

ARNm

Molécula de ARN que se traduce en una o más proteínas en los ribosomas.

Autosoma

Cualquier cromosoma excepto los cromosomas sexuales, X e Y.

Biopsia de vellosidad corial

Procedimiento diagnóstico prenatal invasivo que consiste en la extracción de una pequeña cantidad de tejido de las vellosidades coriales del saco coriónico,a fin de determinar si el bebé tiene una condición genética o una anormalidad cromosómica.

Biomarcador

Fracción de ADN que indica una característica diferencial entre dos individuos, pudiendo así realizar un cribado.También hace referencia a una secuencia de ADN que causa una enfermedad en concreto o que está relacionada con susceptibilidad a padecerla.

Biblioteca genómica

Genoma total clonado en un conjunto de vectores.

Beta HCG

Fracción beta libre de la hormona gonadotropina coriónica; hormona glicoproteica producida en el embarazo, fabricada por el embrión en el desarrollo poco después de la concepción y mas tarde por el sincitiotrofoblasto (parte de la placenta). Su función es evitar la desintegración del cuerpo lútero del ovario y, por ende, mantener la producción de progesterona que es fundamental para el embarazo en los seres humanos. Los niveles pueden ser medidos inicialmente mediante un análisis de sangre, unos 10 -11 días después de la concepción, y aproximadamente 12-14 días después, mediante un test en orina.

Cribado prenatal no invasivo

Test de laboratorio que ayuda a calcular, desde el ADN fetal de la sangre materna, la posibilidad de que exita una trisomía de los cromosomas 9,13,16, 18, 21 y 22, aneuploidías de cromosomas sexuales más comunes y síndromes de microdelección. Estas pruebas se pueden realizar a partir de la semana 10 de embarazo.

Consejo genético

Proceso comunicativo para informar, educar, dar soporte a individuos y familias con una enfermedad genética o riesgo de tenerla. Forma parte de la consulta de genética clínica y puede ser realizado por un genetista clínico o asesor genético.

Conización

Procedimiento quirúrgico que se realiza para obtener una muestra de tejido anormal del cuello uterino para su análisis posterior, con el propósito de diagnosticar o tratar cambios precancerosos en el cuello uterino.

Codón

Secuencia de 3 nucleótidos en la hebra codificadora del ADN o ARNm que representa a un aminoácido específico en el código genético y se traduce en su aminoácido correspondiente en el proceso de traducción. Existen codones que no significan aminoácidos y funcionan como señales de término de la traducción.

Cobertura

Profundidad en la secuenciación de ADN; es el número de lecturas únicas que incluyen un nucleótido determinado en la secuencia reconstruida. La secuenciación profunda hace referencia al concepto general de apuntar a un alto número de lecturas únicas de cada región de una secuencia.

Citosina

Base pirimídica que se encuentra en ADN y ARN. Se une mediante tres enlaces por puente de hidrógeno con G en secuencias de doble hebra.

Citogenética

Estudio de la herencia mediante la aplicación de técnicas citológicas y genéticas.

CNV

Variación de número de copia; alteración de DNA genómico que produce la ganancia o pérdida de material genético cuando éste se compara con un individuo "normal" o "sano".

CCPT

Cribado combinado del primer trimestre (Triple Screening); técnica utilizada para la detección de anomalías cromosómicas,consiste en la realización de una ecografía y de unos análisis de sangre entre las semanas 10 y 12 de embarazo.

Cariotipo

Complemento cromosómico de una célula realizado con cromosomas metafásicos, que se ordenan en parejas de cromosomas homólogos de acuerdo a sus longitudes y posición del centrómero.

Cardiopatías congénitas

Malformaciones estructurales y/o funcionales del corazón presentes desde el nacimiento.

Cromosoma

Estructura física, también llamada cromatina, que consiste en una molécula de ADN compactado organizada en genes y mantenida por proteínas llamadas histonas.

Cromosomas sexuales

Tipo de cromosoma que participa en la determinación del sexo. El ser humano posee dos cromosomas sexuales; el X e Y. Las mujeres tienen dos cromosomas X en sus células somáticas, mientras que los hombres tienen un cromosoma X y un Y. Sin embargo los óvulos contienen solo un cromosoma X, mientras que los espermatozoides pueden contener un cromosoma X o uno Y, por lo que el hombre será el que determine el sexo de la descendencia una vez producida la fertilización.

Cromatina

Sustancia que se utiliza para crear los cromosomas,se encuentra conformada de moléculas de ADN,ARN y de diversas proteínas.Se localiza en el núcleo de cada célula que componen al ser humano.

Deleción

Cualquier pérdida de material genético inferior a un cromosoma. Puede afectar al brazo de un cromosoma, a un gen o a un pequeño número de pares de bases.

Diagnóstico molecular

Conjunto de técnicas biológicas empleadas para la identificación y análisis de biomarcadores en el genoma y proteoma (el código genético y cómo se expresan dichos genes como proteínas), que permiten diagnosticar y monitorizar enfermedades, detectar el riesgo y aplicar un tratamiento personalizado.

Diagnóstico genético

Permite conocer la base genética de una enfermedad hereditaria, siendo una información fundamental para la toma de decisiones respecto a las posibles opciones de tratamiento o el seguimiento de su evolución y pronóstico. Este diagnóstico genético nos puede llegar a proporcionar las herramientas necesarias para ayudar a evitar la transmisión de la enfermedad y para valorar ampliarlo a otros miembros familiares que pueden estar afectados o ser portadores de la afección.

Expresividad

Variabilidad en el grado de manifestación fenotípica de un gen o genes.

Expresión genética

Hace referencia a los procesos de replicación del DNA, transcripción y traducción.

Exón

Secuencia de ADN que se transcribe y es parte de la molécula funcional.

Exoma dirigido

Posibilidad de paneles con el número de genes a elegir en función de la patología. Esta es la mejor opción cuando estamos frente a una mendeliana con clínica definida y con varios genes asociados.

Exoma completo trío

Información de los mas de 19.000 genes que son codificantes en el exoma. Al hacerse trío se reduce la complejidad bioinformática y es posible enfrentar los cambios del caso índice frente a progenitores por lo que aumenta su valor pronóstico.

Exoma clínico

Información de mas de 6.400 genes, todos ellos recogidos en el OMIN por lo que si se obtiene algún cambio al menos sabremos que el gen está descrito.

Exoma

Parte codificante de los genes que formarán parte del ARN mensajero, que a su vez dará lugar a la síntesis de proteínas. Es la parte funcional mas importante del genoma humano y la que contribuye en mayor medida al fenotipo final de un organismo

Estudio genético

Estudio utilizado para identificar la mutación (error en los genes) en el gen responsable de la enfermedad hereditaria.

Estudio de cribado

Estudio que se lleva a cabo para identificar en la población general a personas afectadas por una enfermedad o anomalía que hasta entonces pasaba desapercibida mediante test diagnósticos, exámenes u otras técnicas de aplicación rápida.

Especificidad

Probabilidad de que una muestra negativa sea identificada como tal. Se calcula como TN/(TN+FP) es decir, la fracción de resultados negativos asignados respecto del total de los negativos conocidos. El valor buscado corresponde al 99% de especificidad.

Epigenética

Estudio de los cambios hereditarios en la función genética que se producen sin un cambio en la secuencia del ADN y no pueden ser expresados por la genética,es decir; fenómenos que no afectan a la secuencia de ADN pero sí varián su expresión.

Enfermedades raras

Tambien conocidas como enfermedades minoritarias, huérfanas o poco frecuentes, incluidas las de origen genético; son aquellas con peligro de muerte o de invalidez crónica que tienen una prevalencia menor de 5 casos por cada 10.000 habitantes.

Enfermedad poligénica

También conocidas como enfermedades multifactoriales o complejas; existe más de un gen involucrado en la enfermedad, además de factores ambientales.

Enfermedad monogénica

Existe sólo un gen involucrado en la enfermedad de cada paciente.

Enfermedad mitocondrial

Causadas por genes codificados en el ADN mitocondrial. Se presenta una herencia exclusivamente materna.

Enfermedad cromosomal

Hace referencia a alteraciones en el número de cromosomas o bien a translocaciones cromosómicas.

Enfermedad congénita

Enfermedad que se manifiesta desde antes del nacimiento, ya sea producida por un trastorno durante el desarrollo del embrión, o como consecuencia de un defecto hereditario.

FP

Resultados obtenidos como positivos usando la técnica o método a validar y obtenidos como negativos con otra técnica, con un diagnóstico o con un material de referencia identificado como negativo.

Fracción fetal

Cantidad de ADN fetal libre (fuera de la célula) presente en una determinada muestra de sangre materna, dividido entre el total de ADN libre presente (ADN fetal libre más ADN materno libre); siendo de espeial interés clínico por cómo afecta a la calidad con la que el material genético del feto puede ser detectado.

FN

Resultados obtenidos negativos usando la técnica a validar y obtenidos como positivos con otra técnica, con un diagnóstico o con un material de referencia identificado como positivo.

Fenotipo

Cualidades físicas observables de un organismo, incluyendo su fisiología, morfología y conducta en todos los niveles de descripción, en definitiva, son las propiedades observables de un organismo.

Genoma

Total del material genético de una célula.

Genotipo

Información genética que posee un organismo en particular, en forma de ADN.1 Normalmente el genoma de una especie incluye numerosas variaciones o polimorfismos en muchos de sus genes. El genotipado se usa para determinar qué variaciones específicas existen en el individuo. El genotipo, junto con factores ambientales que actúan sobre el ADN, determina las características del organismo, es decir, su fenotipo.

Guanina

Base púrica presente en ADN y ARN. Se aparea con citosina mediante tres enlaces por puente de H en secuencias duplex.

Genómica

Área del conocimiento encargada descifrar la estructura y el funcionamiento de los genomas en su conjunto. Requiere métodos de alto rendimiento y hace un uso intensivo de la bioinformática.

Genética clínica

Aplicación de los conocimientos de genética al mundo clínico. Sus objetivos son; la asociación genotipo-fenotipo ( búsqueda de asociaciones genéticas), el estudio de heredabilidad de un trastorno y el asesoramiento genético.

Genética

Disciplina científica que estudia el significado, propiedades y función del material genético.

Gen

Secuencia de nucleótidos que codifican para un polipéptido o una cadena de ARN que desempeña alguna función en el organismo.

Gemelo evanescente

Síndrome producido cuando uno de los embriones de un embarazo múltiple desaparece en el útero como resultado de un aborto involuntario y es reabsorbido total o parcialmente por la madre o la placenta.

Histona

Proteína que se combina con el ADN nuclear formando los nucleosomas.

Homocigótico

Individuo que posee dos alelos iguales de un gen.

Heterocigótico

Individuo que posee dos alelos diferentes para una determinada característica.

Hallazgo incidental

Hallazgo de una variante patogénica ( o probablemente patogénica) y con relevancia clínica en un gen no relacionado con el síndrome o la condición por la cual el paciente fue derivado a la consulta.

Intrón

Segmento de un gen que, tras ser transcrito al ARN, se pierde en el proceso de corte-empalme (splicing) que dará el ARNm maduro. No tiene representación en la proteína traducida.

Kilobase

Unidad de longitud de ácidos nucleicos correspondiente a 1000 nucleotidos. Se abrevia como kb para ácidos nucleicos de hebra simple y kbp (kilo par de bases) para ácidos nucleicos de doble hebra.

Locus

Lugar físico que ocupa un gen o una región en un cromosoma.

Líquido amniótico

Fluido líquido que rodea y amortigua al embrión y mas tarde al feto en el interior del saco amniótico (bolsa donde el feto se desarrolla hasta su nacimiento). Protege y sustenta hidráulicamente al feto durante el proceso de gestación.

Mutación heredada

Alteración genética que proviene de uno o los dos progenitores (el progenitor puede ser afecto o no).

Mutación genética

Hace referencia a cualquier alteración que modifique el código genético. Normalmente hace referencia al cambio de uno o pocos nucleótidos dentro de un gen.

Mutación de novo

Alteración genética que aparece por primera vez en la familia.

Mosaico genético

También conocido como mosaicismo; alteración genética en la que, en un mismo individuo coexisten dos o mas poblaciones celulares con distinto genotipo , originadas a partir de un mismo cigoto. Por ejemplo; las células tumorales.

Microarray

Técnica genética para estudio de ganancias o pérdidas de material genético a lo largo de todo el genoma.Es un test diagnóstico (no de cribado) y, en el contexto prenatal, es una prueba que detecta un alto número de síndromes en un plazo de tiempo muy corto, a diferencia del cariotipo convencional.

Metilación del ADN

Adición de grupos metilo al ADN y que generalmente está asociado a la inactivación de genes en cromosomas.

NGS

Next Generation Sequencing. Es una metodología de alto rendimiento que permite una secuenciación rápida de los pares de bases en muestras de ADN o ARN.

Promotor

Secuencia de ADN bicatenario reconocida por la ARN-polimerasa y otros factores de transcripción, necesaria para el inicio de la transcripción de un gen.

Pseudogén

Secuencia nucleótida similar a un gen normal pero que no da como resultado un producto funcional, es decir, que no se expresa.

Purina

Bases nitrogenadas. En ADN y ARN son adenina (A) y guanina (G). En secuencias de ácidos nucleicos de doble hebra una base púrica reconoce a una pirimidina, de manera que la púrica A reconoce a la pirimidina T (en ADN) y U (en ARN). La púrica G reconoce a la pirimidina C.

Proporción de ADN fetal

Cantidad de ADN del feto (placentario) presente en la sangre de la madre.

Portador

Individuo que ha heredado un rasgo genético mutado de una enfermedad, pero no muestra síntomas. Por ejemplo; la hemofília; enfermedad genética localizada en el gen recesivo ligado al X y que no muestra ningún síntoma en el portador.

Polimorfismo cromosomal

Secuencia de ADN que presenta dos ó más variantes en la población.

Pirimidina

Tipo de base nitrogenada. La citosina se encuentra tanto en ADN como en ARN, la timina sólo en ADN y el uracilo únicamente en ARN.

Penetrancia

Capacidad de un gen o genes de expresarse genotípicamente.

PAPP-A

Proteína plasmática asociada al embarazo; glicoproteína sintetizada por el sincitiotrofoblasto y en el endometrio a partir de la séptima semana de embarazo. Inhibe a la elastasa evitando que la zona de implantación del trofoblasto transpase el endometrio.Es un marcador bioquímico.

QF-PCR

Técnica genética que, en el contexto prenatal, identifica determinadas secuencias repetitivas (STR, Short Tandem Repeats) en los cromosomas 21, 18, 13 y XY. Esta identificación y cuantificación nos permite conocer el número de estos cromosomas en tan sólo 24 horas.

Replicación

Proceso por el cual se produce la duplicación del ADN, en donde se generan dos copias iguales a partir de una sola. Este proceso requiere la separación de las dos hebras de la molécula original.

Splicing

Proceso de corte y empalme que se desarrolla sobre el tránscrito temprano de ARN, retirando los intrones y ensamblando posteriormente los exones para llegar a conformar el ADN maduro.

Síndrome de Tuner

Aberración cromosómica que afecta en seres humanos al heterocromosoma X en mujeres.Las mujeres portadoras de esta aberración presentan un cromosoma X menos (monosomía). Así el genotipo normal AAXX cambia a AAXO. Fenotípicamente se caracterizan por ser estériles. Tienden a ser de baja estatura, presentar un cuello ensanchado y menor desarrollo mental.

Síndrome de Patau

Aberración cromosómica que afecta a seres humanos y se presenta con una frecuencia de 1/5.000 al nacimiento y está relacionada con una trisomía del cromosoma 13.

Síndrome de Klinefelter

Aberración cromosómica que afecta en seres humanos al heterocromosoma X en hombres. Los hombres portadores de esta aberración presentan un cromosoma X extra. Fenotípicamente se caracterizan por ser estériles y ocasionalmente presentan retardo mental.

Síndrome de Edwards

Anormalidad aneuploide que afecta a la población humana en una frecuencia de 1/10.000 al nacimiento y está relaciona con una trisomía del cromosoma 18.

Síndrome de Down

Condición clínica en seres humanos caracterizada por varias alteraciones fenotípicas. Genotípicamente los individuos afectados son portadores de una trisomía para el cromosoma 21 (2n+1). Un porcentaje bajo de estos individuos son portadores de una translocación entre uno de los cromosomas del grupo 13 con el cromosoma 21 y, por lo tanto, existe información extra para el cromosoma 21.

SNPs

Single-nucleotide polimorphisms (polimorfismos de un único nuleótido). Tipo de polimorfismo más común en el genoma humano, que se diferencia en un solo par de bases de un gen, con respecto al mismo gen en otro individuo. Son estables y en promedio se encuentran cada 1000 pb en el genoma. Aquellos incluídos en secuencias codificadoras se llaman cSNPs y pueden ser utilizados como marcadores de enfermedades.

Sensibilidad

Capacidad de la prueba para detectar la enfermedad (clasificar correctamente a un individuo enfermo).

Translucencia nucal

Parámetro obtenido por ecografía (ultrasonido abdominal) entre las semanas 11 y 13 de gestación,que mide el engrosamiento del pliegue nucal (parte posterior del cuello) del feto. Dicho engrosamiento se da por aumento de líquido en la zona y se asocia al Síndrome de Down y otras alteraciones genéticas.

Transposón

Secuencias de ADN que pueden cambiar su posición dentro de un genoma. Esto permite que se puedan crear o invertir mutaciones y alterar la identidad genética y el tamaño del genoma de la célula.Está constituido por aproximadamente la mitad del ADN no codificante.

TP

Número de verdaderos positivos; resultados obtenidos positivos usando la técnica a validar y con el mismo resultado bien con otra comparativa, o con un diagnóstico o con un material de referencia identificado como positivo.

TN

Número de verdaderos negativos; resultados obtenidos negativos usando la técnica a validar y con el mismo resultado bien con otra técnica comparativo, o con un diagnóstico o con un material de referencia identificado como negativo.

Test ADN fetal libre en sangre materna

Test de cribado prenatal rápido, seguro, eficaz y preciso, que basa su estudio en el análisis del ADN fetal libre en sangre materna y permite la detección precoz de las trisomías de cromosomas 22, 21, 18, 16, 13 y 9. A su vez informa de la presencia de cromosomas sexuales (indica el sexo fetal), anomalías de cromosomas sexuales más comunes y permite el descarte de determinados síndromes de microdeleción.

Traducción

Síntesis de proteínas en los ribosomas a partir del ARN mensajero.

Transcripción

Síntesis de una copia de ARN complementaria a partir de una de las cadenas sencillas de ADN.

Trisomía

Presencia de una copia adicional de un cromosoma.

Tasa de falsos positivos

Proporción de casos negativos que la prueba detecta como positivos.

VUS

Variante de significado incierto, es decir, no se puede definir si es patogénica o no.

Variante probablemente patogénica

Cuando el cambio nucleotídico presenta una probabilidad de más del 90% de ser patogénica.

Variante probablemente no patogénica

Cuando el cambio nucleotídico presenta una probabilidad de más del 90% de no ser patogénica.

Variante patogénica

Variante que tiene un efecto funcional y en consecuencia puede causar una enfermedad.

Variante no patogénica

Aquella variante para la cual se ha demostrado que no tiene un efecto funcional.

Valor predictivo positivo

Probabilidad de tener la enfermedad si la prueba es positiva

Valor predictivo negativo

Probablidad de no tener la enfermedad si la prueba es negativa.

Validez clínica

Grado en que las proposiciones sobre las hipótesis o teorías investigadas están justificadas por los resultados del estudio.

Variante

Modificación (heredable) en el genoma respecto la secuencia consenso del genoma humano. Puede denominarse mutación o polimorfismo en función de su frecuencia en la población (inferior y superior al 1%, respectivamente). Sin embargo, el AGMG recomienda emplear siempre el término variante.

WES

Whole Exome Sequencing; secuenciación del exoma completo. Técnica genómica para secuenciar todas las regiones de codificación de proteínas de los genes de un genoma (conocido como exoma).

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